Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTERF3Q96E29 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms