Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms