Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC124Q96CT7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC124Q96CT7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC124Q96CT7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC124Q96CT7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC124Q96CT7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC124Q96CT7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms