Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms