Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXJ1Q92949 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms