Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFAP3Q92845 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms