Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 GEM1YAL048C 1989 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 IKI3YLR384C 4050 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 NAM2YLR382C 2685 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 GPI12YMR281W 915 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 POL31YJR006W 1464 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 EPL1YFL024C 2499 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 ASN1YPR145W 1719 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 BCH1YMR237W 2175 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 IFM1YOL023W 2031 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 MEK1YOR351C 1494 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 RPL23BYER117W 414 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 COA2YPL189C-A 207 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 SSE2YBR169C 2082 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 GPR1YDL035C 2886 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 REE1YJL217W 597 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 RPC37YKR025W 849 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 WRS1YOL097C 1299 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 RPL18AYOL120C 561 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 SSB1YDL229W 1842 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 MTR4YJL050W 3222 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 OSH3YHR073W 2991 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 MSS1YMR023C 1581 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 PRE1YER012W 597 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 ENV9YOR246C 993 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 CHS3YBR023C 3498 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 FAA2YER015W 2235 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1B-ORQ92393 PSE1YMR308C 3270 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 YNL247WYNL247W 2304 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 DOG1YHR044C 741 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 STU2YLR045C 2667 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 MIG3YER028C 1185 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 SEC53YFL045C 765 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 RPB9YGL070C 369 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 NAB6YML117W 3405 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 KCH1YJR054W 1494 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 SFI1YLL003W 2841 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 HER2YMR293C 1395 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 NIT3YLR351C 876 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 YAK1YJL141C 2424 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 YGR266WYGR266W 2106 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 VPS64YDR200C 1815 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 STV1YMR054W 2673 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 YOL107WYOL107W 1029 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 ITC1YGL133W 3795 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 FAA3YIL009W 2085 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 PAP2YOL115W 1755 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 VPS41YDR080W 2979 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 RPS12YOR369C 432 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 GAL11YOL051W 3246 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 STR2YJR130C 1920 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 HBT1YDL223C 3141 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 VTH1YIL173W 4650 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 VTH2YJL222W 4650 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 LCL2YLR104W 396 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 YPL260WYPL260W 1656 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 GAS4YOL132W 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 RPN3YER021W 1572 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 TLC1TLC1 1301 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1B-ORQ92393 MUP3YHL036W 1641 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 PPH3YDR075W 927 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 CBT1YKL208W 816 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YLR257WYLR257W 966 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 PRP43YGL120C 2304 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 AVT7YIL088C 1473 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 VTC4YJL012C 2166 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 STE6YKL209C 3873 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 GIS2YNL255C 462 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 ALA1YOR335C 2877 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 XRS2YDR369C 2565 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 SUP45YBR143C 1314 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 HOT1YMR172W 2160 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 PAU23YLR037C 375 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 REC8YPR007C 2043 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 ASI1YMR119W 1875 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 GPI14YJR013W 1212 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YKL107WYKL107W 930 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YDL176WYDL176W 2127 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YGL074CYGL074C 327 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 BCD1YHR040W 1101 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YAL004WYAL004W 648 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 NNK1YKL171W 2787 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 GPI10YGL142C 1851 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 TIP20YGL145W 2106 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 SKI6YGR195W 741 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 CCW14YLR390W-A 717 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-ORQ92393 YDR526CYDR526C 471 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 TIF4632YGL049C 2745 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YJR085CYJR085C 318 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 CDC40YDR364C 1368 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 GRC3YLL035W 1899 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YPL276WYPL276W 438 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 GUP1YGL084C 1683 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 MDN1YLR106C 14733 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 YOL153CYOL153C 1746 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 GFA1YKL104C 2154 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-ORQ92393 RDI1YDL135C 609 nt4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.3 ms