Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNKSR2Q8WXI2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR2Q8WXI2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms