Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPC1Q8WXF1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPC1Q8WXF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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