Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF31Q8WWY3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms