Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWIST2Q8WVJ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms