Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC107Q8WV48 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC107Q8WV48 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms