Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms