Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.46
RB1CC1Q8TDY2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms