Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA3Q8TBC4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms