Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms