Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms