Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms