Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR7Q8N806 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms