Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSL3Q8N5Y2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms