Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC9Q8N567 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms