Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCL2Q8N4E4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL2Q8N4E4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms