Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFRP1Q8N474 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFRP1Q8N474 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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