Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PELI3Q8N2H9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PELI3Q8N2H9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms