Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML4Q8N228 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML4Q8N228 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms