Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD3Q8N144 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms