Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX4Q8IY92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms