Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM2Q8IXS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM2Q8IXS6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM2Q8IXS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms