Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPA1Q8IWL2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA1Q8IWL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms