Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW8

SPNS2, Protein spinster homolog 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2Q8IVW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNS2Q8IVW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS2Q8IVW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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