Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL3Q8IVW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms