Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A9Q8IVB4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms