Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR49Q8IV35 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms