Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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