Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP1Q7Z6B7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP1Q7Z6B7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP1Q7Z6B7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP1Q7Z6B7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP1Q7Z6B7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP1Q7Z6B7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms