Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms