Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG9AQ7Z3C6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms