Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX8Q7RTT4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms