Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms