Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPTNQ6XPR3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms