Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VITQ6UXI7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms