Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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