Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms