Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A1Q6PCB7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A1Q6PCB7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A1Q6PCB7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms