Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLC3Q6P597 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms