Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF544Q6NX49 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms