Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDE2Q6IQ49 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms