Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM236Q5W0B7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM236Q5W0B7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM236Q5W0B7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms