Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARMC3Q5W041 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARMC3Q5W041 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARMC3Q5W041 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARMC3Q5W041 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARMC3Q5W041 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARMC3Q5W041 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms