Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRAGBQ5VZM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRAGBQ5VZM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms